11匹目：ゲッコウガ/第7話「忍者村決戦！ゲコガシラ対キリキザン！！」
サトシたちはサンペイと共に忍者村を訪れるのですが、元忍者村出身のカゲトモに襲撃されるトラブルに巻き込まれます。このトラブルで現頭領のハンゾウが連れ去られて、サトシたちも協力して取り返しに行くことになりました。頭領が捉えられている所に向かう途中にヘイダユウという手下とのバトルが始まります。そのバトルの最中にゲコガシラはゲッコウガに進化しました。
12匹目：オンバーン/第17話「サンダーとオンバーン！怒りの雷撃！！」
サトシたちはサンダーに因んだ祭りがあるという情報を聞き、その祭りに参加する町に向かうことにしました。しかし、その道の途中に雷雨に見舞われて近くの洞窟で雨宿りすることになります。サトシたちは洞窟に入るとケガをして動けなくなっている男性スタンと出会います、スタンに話を聞くと、どうやら町に車で薬を届ける最中に雷で運転を誤って事故を起こしてしまったそうです。スタンはサトシたちに自分はいいから町に薬を届けてくれと依頼して、サトシたちもそれを承諾しました。そして雨宿りしていた洞窟を通って外に出ようとすると、サンダーが待ち構えており、出口の岩陰にロケット団が隠れていました。サンダーはロケット団に襲撃されて怒り状態でトンネルから出ることを許してくれません。智は話せばわかるといい出て行きますが、攻撃されたためポケモンたちを駆使して足止めしながら突っ走ります。ですが、一匹目のファイアローがやられしまいます。2匹目のルチャブルも善戦しますが、やられて墜落していきました。それを見ていたオンバットは、尊敬するルチャブルが墜落していくのを助けるために全速力で飛行してルチャブルのところへ突っ込んでいくのですが、その飛行中にオンバットのルチャブルを助けたい気持ちが強かったのか、体が急に光り出してオンバットに進化しました。
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